0 0 lang="en-US"> B.A 2 Varianten og Ukesrapporten uke 1 – Politikeren
Site icon Politikeren

B.A 2 Varianten og Ukesrapporten uke 1

Advertisements
Read Time:7 Minute, 55 Second

Nesten 80 % av Covid-positive prøver sendt for genom-sekvensering av laboratorier i byen Kolkata har vist seg å inneholde BA.2-underlinjen til Omicron-varianten, med kallenavnet “stealth-versjonen”, siden den ikke kan plukkes opp i RT -PCR-tester og krever genom-sekvensering.

Interessant nok hadde nesten ingen av de som ble funnet infisert med BA.2 noen umiddelbar historie med utenlandsreiser; den andre underslekten – BA.1 – har blitt oppdaget hos de som hadde reist til utlandet i den siste tiden, sa en høytstående helsepersonell, det tyder på at B.A2 mest sannsynligvis har sirkulert i byen lenge.

Media i norge klistrer store røde og svarte overskrifter over alle nettaviser om den store stemmer “Stealth” versjonen av Omikron-varianten, tydeligvis var ikke Omicron skummel nok, med Stealth foran går det nok forte inn hos folk hvor “farlig” den er.

Fra den originale B.1.1.529-varianten (først oppdaget i Sør-Afrika), har Omicron nå delt inn i tre undertyper: BA.1, BA.2 og BA.3. Ingen forekomst av BA.3 er så langt identifisert i India. I Maharashtra og noen andre stater sirkulerer BA.1 dominerende i samfunnet, og erstatter raskt Delta-varianten, som rapportert i mandagens “TOI”.

BA.2 kan ikke identifiseres av prøver brukt i RT-PCR-testen. BA.1-underlinjen bærer den karakteristiske S-gen-frafallsmutasjonen, noe BA.2 ikke gjør. Fraværet av en S-genmutasjon i en RT-PCR-test er derfor en indikasjon på en Omicron-indikasjon. Men for å identifisere en BA.2-infeksjon er genomsekvensering en nødvendighet.

Rundt 150 positive prøver fra samfunnet er allerede sekvensert. Mens omtrent 80 % er Omicron-positive, ble alle funnet BA.2-positive, bortsett fra én eller to prøver. Alle disse prøvene hadde en CT-verdi under 30, noe som indikerer høy virusmengde. Disse prøvene ble sendt for genom-sekvensering mellom 22. og 28. desember.

Funnene indikerer at BA.2-underlinjen dominerer i samfunnet i Kolkata og tilstøtende områder, hvorfra de fleste prøvene ble sendt for genomsekvensering. “Det er mulig at BA.2 forårsaker den lokale klyngeinfeksjonen. Selv om denne underlinjen er forskjellig fra sine andre “søsken”, tilhører den genetisk den samme familien, og det er derfor ingen signifikant forskjell i det kliniske forløpet av sykdommen, ” sa immunolog Dipyaman Ganguly fra Indian Institute of Chemical Biology.

I prøvene sendt av ett laboratorium ble det funnet 34 covid-positive prøver med BA.2. En prøve var Omicron BA.1 og åtte var Delta og Delta pluss. Av de 17 Covid-positive prøvene sendt av et annet laboratorium, var 14 Omicron og tilhørte BA.2-linjen og resten Delta. Funn på de 50 prøvene sendt av det tredje laboratoriet viste at 35 var BA.2.

“Viruset vil fortsette å mutere. Derfor er det et behov for genomisk sekvensovervåking,” sier Peerless Hospitals mikrobiolog Bhaskar Narayan Chaudhuri.

Regjeringen, rundt den tredje uken i desember, hadde bestemt seg for å sende alle positive prøver med CT-verdi under 30 for genom-sekvensering for å oppdage overføring av Omicron i samfunnet. Følgelig begynte laboratorier i Kolkata, Salt Lake og New Town å sende inn prøver.

Helseavdelingen hadde omgjort avgjørelsen en uke senere da det var klart at smitte med Omicron i samfunnet hadde begynt.
“Omtrent 70 % av prøvene testet positive til Omicron, for det meste av BA.2-linjen. Dette var en uke siden. Gitt den høye overføringsevnen, vil tilstedeværelsen av Omicron sannsynligvis ha økt mye mer,” sa Shelly Sharma Ganguly, AMRI Dhakuria mikrobiolog.

Foreløpig er det altså ingen som helst indikasjoner på at B.A2 eller “Omicron Stealth” er mere alvorlig enn Omicron, mest sannsynligvis er det kliniske forløpet relativt likt og kanskje en smule mindre farlig.

I Norge er det påvist flere hundre tilfeller av denne undervarianten som media nå prøver å skremme opp, det er ingen tegn på at flere dør av i kalkota eller India forøvrig til tross for høy grad av B.A2 siden desember, i tillegg har de rundt 200.000 nye smittetilfeller hver dag men et stabilt lavt dødstall av covid-19.

På det høyeste med Delta hadde India mellom 5-10.000 dødsfall hver dag nå ligger det på mellom 200-400 i døgnet og stabilt. Til tross for eksplosjon av smitte.

Trykk på bilde for kilde
Trykk på bilde for kilde

Så min første analyse av B.A2 varianten av Omikron-varianten, den såkalte “Stealth” versjonen er at den har mange nye mutasjoner men at det kliniske forløpet er relativt likt som Omikron-varianten, den gir muligens også litt mindre symptomer siden den ser ut til å overta fra den svært smittsomme Omikron-varianten som kan gi en del lette og milde symptomer relativt tidlig som gjør at folk holder seg hjemme.

Alt jeg finner på nett fra troverdige kilder rundt denne nye undergruppen som egentlig ikke er ny, den ble funnet tidlig i desember er at den er vanskelig å oppdage, finner ingenting iløpet av de to månedene som snart har gått at denne varianten er noe farligere, kun media som lager fryktporno.

De studiene jeg har lest idag handler hovedsakelig om at B.A.2 er nettopp bare det, en undergruppe av Omikron-varianten, det er lite studier om alvorlighet, sykdom pg annet selv snart to måneder etterpå. Dette gir selvfølgelig rom for media å spekulere en del.

I India har altså B.A.2 vært dominerende siden desember, vi husker jo godt hvordan media fremstilte Omicron?

Forhåpentligvis så kan Omicron, B.A.1, B.A.2 og B.A.3 være et slags tilsvar på Influensa A, B og B Victoria. Forhåpentligvis. Akkurat tror jeg ikke det er særlig mere å frykte. Har du alvorlig fedme, hjerte karsykdommer, er over 65år og overvekt med BMI over 30 så kan det være lurt å ha en samtale med fastlegen om råd.

Foreløpig analyse av norske data har estimert at risikoen for sykehusinnleggelse med covid-19 som hovedårsak etter infeksjon med omikronvarianten var 69 % lavere, sammenlignet med infeksjon med deltavarianten.

Det skriver FHI i sin ukerapport for årets første uke.

Ukesrapport 1 Folkehelseinstituttet

De Vaksinerte er igjen flertall på sykehuset av de innlagte med covid-19, som vi vet er rundt 1 av 4 innlagte der for andre grunner en covid-19 smitte de har bare testet rutinemessig posetivt ved innleggelse.

Blant 138 nye pasienter innlagt i sykehus i Norge med covid-19 som hovedårsak i uke 1, var 64 (49 %) uvaksinert, 39 (30 %) fullvaksinert med to doser og 24 (18 %) fullvaksinert med tre doser.

Det har vært en nedgang i antall registrerte covid-19 assosierte dødsfall siste tre uker. Det er foreløpig registrert 19 covid-19 assosierte dødsfall i uke 1, en halvering sammenlignet med uke 52 (38). Antallet for uke 1 kan bli oppjustert. I uke 1 var medianalder 84 år.

Det som og er ganske hyggelig nå er at FHI skiller tydelig på hvem som er innlagt med hva. Se gjerne her:

Det var altså 79 innlagte pasienter som testet posetiv for covid-19 som var innlagt for andre årsaker.

Fra begynnelsen av vaksinasjonsprogrammet frem til og med uke 1 er det tilgjengelig informasjon om vaksinestatus for 929 antall covid-19 assosierte dødsfall. Blant disse har det vært 496 (53,4 %) covid19 assosierte dødsfall blant uvaksinerte og 404 (43,5 %) dødsfall blant fullvaksinerte. Av disse 404 fullvaksinerte hadde 44 mottatt en tredje dose. 29 (3,1 %) var delvis vaksinerte.

Det er altså en marginal forskjell på antall døde uvaksinerte/vaksinerte til tross for at vaksinasjon i norge egentlig kom skikkelig igang før i juni 2021, store deler av befolkningen var altså uvaksinert halve året 2021 og derfor kan man se en litt overtall av uvaksinerte døde av covid-19 I 2021. Dette vil sannsynligvis forandre seg “som forventet” i 2022. (Ja jeg tok en FHI)

For de siste fire uker er informasjon om vaksinestatus tilgjengelig for 160 covid-19 assosierte dødsfall. Blant disse har det vært 66 (41,2 %) covid-19 assosierte dødsfall blant uvaksinerte og 91 (56,9 %) dødsfall blant fullvaksinerte. Av disse 91 fullvaksinerte hadde 21 mottatt en tredje dose. 3 (1,9 %) var delvis vaksinerte. Medianalder for vaksinerte/uvaksinerte er 81år og 82år.

Insidensen er nå krympet ytterligere inn pg nærmest ingen forskjell på antall smittede de to siste ukene står den nå på Vaksinert/ uvaksinert, 660/762 i uke 52 til 1169/1138. Insidensen har altså snudd slik jeg har forklart den ville gjøre for noen uker siden. Derfor går og FHI over på å mikse med andre tall enn de vi er vant til å se i media og på Facebook siden deres tidligere.

Trykk på bildet for å laste ned hele rapporten
Som dere kam se på 18år-44år så er insidensen snudd, også fra 45-64 er insidensen nå nesten snudd og snart er den snudd for samtlige grupper, da vil nok FHI skylde på at det er fordi det er så mange vaksinerte.

Som vi kan se under her er også insidensen for hver dag snudd fullstendig.

FHI forventer også at insidensen snur kraftig fremmover i sine rapporter så de vil nok fokusere mest på friske vaksinerte som ikke er i respirator fremmover..

Vi kan også ta en titt på sykehusinnleggelser nærmere så ser man også at der holder insidensen på å snu ganske kraftig til å kun være vaksinerte som blir lagt inn, selvom det er tidlig er det tydelig et skifte. Om det er som følge av flokkimmunitet hos uvaksinerte er usikkert men uansett er det et skifte.

Du kan trykke på alle bilder og komme til kildene til bildene.

Happy
0 0 %
Sad
0 0 %
Excited
0 0 %
Sleepy
0 0 %
Angry
0 0 %
Exit mobile version